蛋白定量
蛋白定量即蛋白質(zhì)定量,蛋白質(zhì)定量根據其目的分為蛋白質(zhì)的“總定量”和特定蛋白質(zhì)的“個(gè)別定量”。蛋白定量是生物學(xué)實(shí)驗不可缺少的一部分,為驗證細胞裂解是否成功,或為了將多個(gè)樣品進(jìn)行平行實(shí)驗比較或標準化保存,需對細胞裂解液進(jìn)行蛋白定量;為了判定蛋白的產(chǎn)量,需對純化好的蛋白進(jìn)行定量;為了將純化好的蛋白用生物素或報告酶進(jìn)行標記,同樣需要首先對蛋白樣品進(jìn)行定量,以保證標記反應在適當的化學(xué)濃度下進(jìn)行。
蛋白質(zhì)是一種十分重要的生物大分子,它種類(lèi)繁多,結構不一,功能各異,分子量相差很大,因此建立一個(gè)理想而又通用的蛋白質(zhì)定量分析方法很因難。
現測定蛋白質(zhì)含量的方法有很多:根據物理性質(zhì)來(lái)分有紫外分光光度法;根據化學(xué)性質(zhì)來(lái)分有凱氏定氮法、雙縮脲法、Folin-酚試劑法(Lowary法)、BCA法和膠體金法;根據染色性質(zhì)有考馬斯亮藍染色法、銀染法;根據其他性質(zhì)有熒光法;其中較為常見(jiàn)的有以下五種。
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紫外分光光度法
蛋白質(zhì)分子中含有共軛雙鍵的酪氨酸、色氨酸等芳香族氨基酸具有吸收紫外光的性質(zhì),其吸收高峰在280 nm波長(cháng)處,且在此波長(cháng)內吸收峰的光密度值與蛋白濃度成正比,故可作為蛋白質(zhì)定量測定的依據。該方法是最快的蛋白質(zhì)定量方法,但由于各種蛋白質(zhì)中酪氨酸和色氨酸含量不同,如要準確定量則應有待測蛋白質(zhì)的純品作為標準來(lái)比較,或者知道其消光系數作為參考。另外,不少雜質(zhì)在280 nm波長(cháng)下也有—定吸收能力,可能發(fā)生干擾,其中核酸(嘌呤和嘧啶)的影響尤為嚴重。核酸的最大吸收峰是在260 nm,因此若溶液中存在核酸,必須同時(shí)測定OD260與OD280,然后根據兩種波長(cháng)的吸收度比值,通過(guò)經(jīng)驗公式校正,以消除核酸的影響而推算出蛋白質(zhì)的真實(shí)含量。
操作簡(jiǎn)便迅速,且不消耗樣品(可以回收),多用于純化蛋白質(zhì)的微量測定。
(1)當待測的蛋白質(zhì)與標準蛋白質(zhì)中的酪氨酸和色氨酸含量差異較大時(shí),會(huì )產(chǎn)生—定誤差。
(2)混有核酸時(shí)必須分別測定280 nm和260 nm兩處的OD值,再按公式推算蛋白質(zhì)含量。
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雙縮脲法
雙縮脲(NH3CONHCONH3)是兩個(gè)分子脲經(jīng)180℃左右加熱放出一個(gè)分子氨后得到的產(chǎn)物。在強堿性溶液中,雙縮脲與CuSO4形成紫色絡(luò )合物,稱(chēng)為雙縮脲反應。凡具有兩個(gè)酰胺基或兩個(gè)直接連接的肽鍵,或能通過(guò)一個(gè)中間碳原子相連的肽鍵,這類(lèi)化合物都有雙縮脲反應。紫色絡(luò )合物顏色的深淺與蛋白質(zhì)濃度成正比,而與蛋白質(zhì)分子量及氨基酸成分無(wú)關(guān),故可用來(lái)測定蛋白質(zhì)含量。測定范圍為1-10 mg蛋白質(zhì)。干擾這一測定的物質(zhì)主要有硫酸銨、Tris緩沖液和某些氨基酸等。
較快速 ,不同的蛋白質(zhì)產(chǎn)生顏色的深淺相近,以及干擾物質(zhì)少。
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考馬斯(Comessie)亮蘭結合法
考馬斯亮蘭結合法是近年來(lái)發(fā)展起來(lái)的蛋白質(zhì)定量測定法??捡R斯亮蘭能與蛋白質(zhì)的疏水區相結合,這種結合具有高敏感性,考馬斯亮蘭G250 的最大光吸收峰在465 nm,當它與蛋白質(zhì)結合形成復合物時(shí),其最大吸收峰變?yōu)?95 nm。在一定范圍內,考馬斯亮蘭G250-蛋白質(zhì)復合物呈青色。在595 nm下,光密度與蛋白質(zhì)含量呈線(xiàn)性關(guān)系。故可以用于蛋白質(zhì)含量的測定。
(1)操作簡(jiǎn)便、快速;檢測靈敏;重復性好。
(2)顯色迅速,約2分鐘內可完成染料與蛋白質(zhì)的結合,所現顏色至少在1小時(shí)內是穩定的。
(3)與改良Lowary法相比,干擾物質(zhì)較少。
(1)當樣品中存在較大量的SDS、TritonX-100等去垢劑時(shí),顯色反應會(huì )受到干擾。如樣品緩沖液呈強堿性時(shí)也會(huì )影響顯色,故必須預先處理樣品。
(2)考馬斯亮蘭G250染液不宜久存,以1-2月為宜。
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Lowary蛋白定量法
Lowary法是雙縮脲法和福林酚法的結合與發(fā)展,其原理是:蛋白質(zhì)溶液用堿性銅溶液處理,形成銅-蛋白質(zhì)的絡(luò )合鹽,在加入酚試劑后,除使肽鏈中酪氨酸、色氨酸和半胱氨酸等顯色外,還使雙縮脲法中肽鍵、堿性銅的顯色效果更強烈。因此,Lowary法的顯色效果比單獨使用酚試劑強烈3-15倍,為雙縮脲法的100倍。由于肽鍵顯色效果增強,從而減小了因蛋白質(zhì)種類(lèi)引起的偏差。
注意事項
(1)酚試劑只在酸性條件穩定,故當其加到堿性的銅-蛋白質(zhì)溶液中時(shí),必須立即混勻,以便在磷鉬酸-磷鎢酸試劑被破壞前,還原反應即能發(fā)生。
(2)為了保證反應進(jìn)行完全,反應在25~30℃水浴中進(jìn)行,反應30 min后準時(shí)比色。
(3)避免還原物質(zhì)干擾本實(shí)驗。
微克級高靈敏度定量測定,穩定。
(1)受植物體內存在的酚類(lèi)物質(zhì)干擾。
(2)去污劑如TritonX-100,SDS,NP-40的濃度超過(guò)0.2%時(shí)會(huì )影響定量結果。
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BCA法
BCA蛋白定量法需要兩種試劑:
試劑A:稱(chēng)取1 g sodium bicinchoninate,2 g Na2CO3,0.16 g酒石酸鈉,0.4 g NaOH和0.95 g NaHCO3,定容到100 ml,用NaOH將pH調到11.25。
試劑B:將0.4 g CuSO4•5H2O溶于10 ml水中。
工作液:100份試劑A和2份試劑B混合。
測量方法:取25 μl 標準品加入到200 μl BCA工作液中,37℃或60 ℃孵育30 min,檢測562 nm處的吸光度繪制標準曲線(xiàn)。用同樣的方法檢測蛋白樣品的吸光度可算出蛋白樣品的濃度。
(1)靈敏度高,檢測濃度下限達到25 μg/ml,最小檢測蛋白量達到0.5 μg,待測樣品體積為1-20 μl。
(2)操作簡(jiǎn)單,快速,45分鐘內完成測定,比經(jīng)典的Lowary法快4倍且更加方便。
(3)測定蛋白濃度不受絕大部分樣品中的去污劑等化學(xué)物質(zhì)的影響,可以兼容樣品中高達5%的SDS,5%的Triton X-100,5%的Tween 20,60,80。
(4)在20-200 μg/ml濃度范圍內有良好的線(xiàn)性關(guān)系。
(5)檢測不同蛋白質(zhì)分子的變異系數遠小于考馬斯亮藍蛋白定量法。
(6)經(jīng)濟實(shí)用,除試管外,測定可在微板孔中進(jìn)行,大大節約樣品和試劑用量。
受螯合劑和略高濃度的還原劑(EDTA小于10 mM,DTT小于1 mM,巰基乙醇低于1mM)的影響。
以上是針對全蛋白質(zhì)的“總定量法”,然而許多實(shí)驗需要對溶液中特定蛋白進(jìn)行定量分析,即針對特定蛋白質(zhì)的“個(gè)別定量”。針對特定蛋白定量常用的方法有酶聯(lián)免疫吸附試驗法(ELISA),免疫印跡分析法(WB)和質(zhì)譜檢測(MS)。
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ELISA
ELISA是溶液中特定蛋白定量的一種常用方法,通常是在96孔板上進(jìn)行,關(guān)鍵步驟是特定抗原/蛋白的固定。具體來(lái)說(shuō),ELISA有不同變種。
直接或間接ELISA
特定抗原/蛋白直接吸附到檢測板,封閉未被抗原包被的孔板表面,然后在孔板中加入酶標(直接ELISA)或未酶標(間接ELISA)的第一抗體,在測試孔板中,一抗與抗原/蛋白相結合。對于未酶標的第一抗體,加入酶標的第二抗體與第一抗體結合。最后,加入酶底物(通常是四甲基聯(lián)苯胺TMB或堿性磷酸酶ALP)使溶液發(fā)生顏色變化然后使用分光光度計檢測。顏色變化與蛋白質(zhì)濃度是直接相關(guān)的。
直接ELISA的優(yōu)點(diǎn)是速度快,并且沒(méi)有第二抗體的交叉反應問(wèn)題,但局限是第一抗體的標記可能是費時(shí)和昂貴的。此外,信號放大是最弱的。因此,更常用的是
夾心ELISA
特定抗原/蛋白結合在孔板表面包被的第一抗體(捕獲抗體)和酶標的第二抗體(檢測抗體)之間,第二抗體比較容易買(mǎi)到,但可能會(huì )發(fā)生第二抗體的交叉反應。
任何ELISA測定蛋白質(zhì)濃度的一個(gè)重要環(huán)節都是蛋白質(zhì)標準曲線(xiàn),通常是連續稀釋已知濃度的蛋白質(zhì),從而繪制標準曲線(xiàn)。
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WB
WB只能半定量。通過(guò)凝膠電泳把原始或變性的蛋白質(zhì)分開(kāi),把蛋白質(zhì)轉膜(硝酸纖維素或PVDF),然后使用特定的酶標抗體檢測。最后,加入適當的底物(化學(xué)發(fā)光底物)產(chǎn)生可檢測的信號。雖然WB比ELISA更費時(shí),但是WB不僅可以對特定的蛋白進(jìn)行定量,而且可以在實(shí)驗中同時(shí)檢測蛋白質(zhì)修飾。
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MS
MS是蛋白質(zhì)定量的新興方法。在蛋白質(zhì)組學(xué)分析中,除了蛋白定性之外,一個(gè)重要的步驟就是對特定的蛋白進(jìn)行定量分析。MS定量蛋白的方法有很多。
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常用的方法是較重的穩定同位素碳(13C)或氮(15N)加入到第一個(gè)樣本(多肽或蛋白質(zhì)),而相應的輕同位素(12C和14N)加入到第二個(gè)樣本(內標),然后混合這兩個(gè)樣本進(jìn)行分析。由于兩個(gè)樣本的質(zhì)量差,用質(zhì)譜分析儀測定的兩個(gè)樣本峰強度的比值就相當于其相對豐度比。
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質(zhì)譜蛋白定量的第二種方法,可以不用標記樣本,即用基質(zhì)輔助激光解吸/電離 - MALDI分析。
使用質(zhì)譜這種通用方法可以在一次實(shí)驗中同時(shí)進(jìn)行定量和定性檢測。但這種方法需要的檢測儀器很昂貴,從而限制了該方法的使用。
總之,雖然測定蛋白質(zhì)含量的方法很多,但還沒(méi)有一個(gè)完美的方法。在選擇測定方法時(shí),可根據實(shí)驗要求和實(shí)驗室條件決定。