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    原核表達系統案例展示

    發(fā)表時(shí)間:2022-01-22 訪(fǎng)問(wèn)次數:2197

    一、需求分析

      客戶(hù)需求:可提供蛋白序列,希望得到純度85%左右的500μg蛋白,蛋白后續用于酶活實(shí)驗,項目預算有限,后期可能需要大量蛋白。

      需求分析

      如項目預算有限,建議優(yōu)先選擇原核表達系統,成本較為低廉,如后續需要進(jìn)行大體積放大,可直接進(jìn)行發(fā)酵,工藝成本更低;對于酶的表達,普健的大腸桿菌表達系統在已往項目中有較為積極的客戶(hù)反饋; 基于以上分析,普健建議該項目選用大腸桿菌表達系統。

    二、蛋白性質(zhì)分析

      將蛋白序列在蛋白數據庫Uniport中比對,一致性較高為80.9%,用生物信息學(xué)工具進(jìn)行蛋白性質(zhì)分析。

      跨膜結構域預測:

    原核表達系統

     

      信號肽預測:

    原核表達系統

     

      疏水性預測:

    原核表達系統

     

        蛋白性質(zhì)總結:客戶(hù)提供蛋白序列一共234 AAs,蛋白大小為25.39 KDa,pI為8.80,疏水性一般,無(wú)跨膜結 構域,無(wú)信號肽,無(wú)糖基化及二硫鍵修飾。

    三、實(shí)驗設計

      綜合蛋白性質(zhì)及客戶(hù)需求分析,設計蛋白表達方案如下:選擇大腸桿菌表達系統,表達目的蛋白全長(cháng),N端融合6*His標簽,表達載體為pET28b,選用BL21(DE3)、T7E為表達菌株,設置多個(gè)誘導溫度及誘導時(shí)間,根據表達測試結果,選擇最優(yōu)條件進(jìn)行200mL放大,收集樣品采用Ni柱純化,交付蛋白樣品。

    四、實(shí)驗方法及實(shí)驗結果

      1、表達載體構建

      利用生物信息學(xué)工具對目的蛋白全長(cháng)片段進(jìn)行密碼子優(yōu)化,降低稀有密碼子水平,用化學(xué)合成方法獲得目的蛋白基因序列片段,將片段亞克隆到pET28b表達載體,進(jìn)行雙酶切驗證及測序確認。進(jìn)行雙酶切驗證及測序確認。

      測序結果:

    原核表達系統

     

      雙酶切驗證結果:

     

          結果分析:NdeI/XhoI雙酶切測試結果顯示片段大小正確,測序結果顯示序列一致,確認蛋白表達載體構建成功。

      2、表達測試

      將表達載體轉化至BL21(DE3)菌株、T7E菌株,挑取陽(yáng)性克隆轉移到含Kana抗性的LB培養基上,37℃培養3-4h,加入1mM IPTG誘導表達,一組37℃培養4h,另一組16℃培養16h過(guò)夜,收集蛋白樣品進(jìn)行SDS-PAGE檢測。

      SDS-PAGE結果:

     

      結果分析:根據SDS-PAGE結果,蛋白大小在25KD左右,與預測蛋白大小相符,比較各條件下蛋白表達情況,確認該蛋白最優(yōu)的表達條件如下:

    菌株 溫度 誘導時(shí)間
    T7E 菌株 37℃ 4h

      3、放大純化

      按照得到的最優(yōu)表達條件,轉化200mL大腸桿菌,37℃培養3-4h,1mM IPTG誘導后,37℃培養4h,收集蛋白樣品,用Ni柱進(jìn)行蛋白純化,得到最終蛋白樣品。

      4、QC檢測

      將最終得到的蛋白樣品進(jìn)行濃度測定、SDS-PAGE檢測及His標簽抗體的WB檢測。

      SDS-PAGE檢測及WB檢測結果:

                    

     

    結果分析:SDS-PAGE結果顯示蛋白大小在25KD左右,且蛋白純度較好,約為95%; His標簽抗體的WB檢測結果顯示25KD左右曝出條帶,與目的蛋白預測大小相符。

    五、交付材料

    序號 樣品 濃度 分裝 緩沖液 管數
    1 蛋白 1.00mg/ml 1.50ml/管 PBS pH7.5 2管
    2 表達載體 100ng/ul  15ul/管 TE 1管
    3 表達菌株 /  1.00ml/管 / 1管
    合計管數: 4管

    六、項目結題

      從基因合成到交付蛋白樣品,項目為期5周,得到3.00mg目的蛋白樣品,由于酶活測試的多樣性與特殊性,交付給客戶(hù)進(jìn)行驗收及酶活測試,客戶(hù)驗證蛋白大小純度均與QC結果一致,酶活實(shí)驗結果表明蛋白有生物活性,綜上,項目順利結題。

     

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